作為引導(dǎo)基金支持科技成果轉(zhuǎn)化的重要方式之一，設(shè)立子基金的運(yùn)作和管理充分體現(xiàn)了引導(dǎo)性、市場(chǎng)化和非營(yíng)利性的特點(diǎn)。

在引導(dǎo)性上，通過(guò)政策激勵(lì)，引導(dǎo)金融資本、民間資本、地方政府資金以及其他投資者共同參與設(shè)立子基金，形成有效資本供給，并通過(guò)建立國(guó)家科技成果轉(zhuǎn)化項(xiàng)目庫(kù)，規(guī)定子基金對(duì)科技成果轉(zhuǎn)化的投資比例等措施，引導(dǎo)資本投向財(cái)政資金形成科技成果的轉(zhuǎn)化應(yīng)用。

在市場(chǎng)化上，引導(dǎo)基金作為母基金，不直接對(duì)科技成果轉(zhuǎn)化項(xiàng)目投資，也不參與子基金的日常管理。子基金完全按照公司法、合伙企業(yè)法的規(guī)定設(shè)立，其運(yùn)營(yíng)交由專業(yè)化創(chuàng)業(yè)投資管理企業(yè)負(fù)責(zé)，引導(dǎo)基金與其他出資人根據(jù)出資額享有同等權(quán)利和義務(wù)。

在非營(yíng)利性上，引導(dǎo)基金不以營(yíng)利為目的。在子基金存續(xù)期內(nèi)，子基金的股東（出資人）在同等條件下優(yōu)先購(gòu)買引導(dǎo)基金所持的子基金股權(quán)或份額。轉(zhuǎn)讓時(shí)，對(duì)于發(fā)起設(shè)立的子基金，注冊(cè)之日起4年內(nèi)（含4年）購(gòu)買的，以引導(dǎo)基金原始出資額轉(zhuǎn)讓；4年至6年內(nèi)（含6年）購(gòu)買的，以引導(dǎo)基金原始出資額及從第5年起按照轉(zhuǎn)讓時(shí)中國(guó)人民銀行公布的1年期貸款基準(zhǔn)利率計(jì)算的利息之和轉(zhuǎn)讓。對(duì)于增資設(shè)立的子基金的，上述年限從子基金完成變更登記手續(xù)之日起計(jì)算。子基金存續(xù)期結(jié)束時(shí)，子基金的年平均收益率不低于子基金出資時(shí)中國(guó)人民銀行公布的一年期貸款基準(zhǔn)利率的，引導(dǎo)基金可將其不超過(guò)20%的收益獎(jiǎng)勵(lì)子基金管理機(jī)構(gòu)。